奇怪的声音在天空中回荡，凡是听到的人都会陷入昏迷，然后消失不见。这一现象引起专家小组精英胜利队的注意，于是，昴星队长派人前去调查。只不过没想到的是，在前方等待他们的是一支庞大的外星人大军以及“吉伯斯教授”。吉伯斯教授乘坐漆黑的堡垒飞船“佐尔加乌斯”来到了地球，他是一个企图扭曲宇宙的统治者。奏大为了保护队友变身成了的奥特曼，数量庞大的敌人让奏大陷入了苦战。就在此时，奏大遇到了一个名叫帝纳斯的神秘女人。帝纳斯与吉伯斯相识，肩负着守护一切的使命，帝纳斯凭借神秘力量和精英胜利队联手，去对抗邪恶的阴谋。但可怕的是，

桐人、尤吉欧、爱丽丝。距离两名修剑士和一名整合骑士打败了最高祭司阿多米尼斯多雷特已过去了半年。结束了战斗，爱丽丝在故乡卢利特村生活。在她的身旁，是失去了挚友，自己也失去了手臂和心的桐人。献身般支撑着他的爱丽丝，丝毫没有保留像以前一样作为骑士的心。“告诉我，桐人……我究竟该怎么办？”然而，通往将 Underworld 全境引向悲剧的“最终压力测试”的倒计时，却毫不留情地推进着。仿佛与之相呼应一般，在“黑暗领域”的深处，暗黑神贝库达复活了。他率领暗黑帝国的军队，为了得到“光之巫女”，开始向“人界”进攻。指挥“

进次郎被噩梦所困扰。他梦到了曾经光之巨人奥特曼与怪兽“芝顿”对峙的梦。而且，他现在遇到了全新的问题，那就是日渐增强的奥特曼之力已经渐渐难以控制了。就在这段时间发生了假冒机动奥特曼破坏街道的事件。世界上“奥特曼危机”的舆论愈演愈烈，科特队陷入了口诛笔伐之中。只不过，这些全都是某个外星人的阴谋罢了。其中的幕后黑手居然是艾德！艾德目的只有一个，终结地球人对于奥特曼的信仰。为此，艾德引导进次郎走向成为光之巨人的道路，然后再打败进次郎。 巨大化的芝顿被艾德召唤并与科特队展开了激烈的战斗。奥特六兄弟与玛丽装甲集结，并

女保镖巴尔莎和皇太子查古穆再次共同踏上旅途。曾在巴尔莎的保护下活下来的小男孩，在艰辛的旅程中，长成了伟大的皇太子。两人来到了巴尔莎的故乡砍巴尔王国。在美丽而严酷的大自然中，巴尔莎揭开了埋藏在王国深处的阴谋。另一方面，新尤古国遭到塔鲁修帝国攻击，查古穆为了拯救濒死的新尤古国，与罗塔王国及砍巴尔王国结城同盟归来逆转了形势。北方诸国蠢蠢欲动，查古穆与父王的对决一触即发。巴尔莎全力寻找成为战争牺牲品的汤达，终于与重伤的汤达重逢，但却一起被塔鲁修军队俘获。于是，查古穆来到塔鲁修大军的营地。塔鲁修帝国的拉尔鲁王子和查