魔教教主任我行无故失踪，左护法曲洋被指为凶手，曲洋绑架了任我行的女儿任盈盈，消去了任盈盈的记忆，以父女相称，两人隐姓埋名，过着平静闲散的日子。东方不败接替任我行成为了新一任的教主，并且得知了曲洋的下落，他决定夺回任盈盈。华山派大弟子令狐冲前往祝贺衡山派掌门刘正风退位，然当日，左冷禅却污蔑刘正风同曲洋有着不可告人的秘密。最终，刘正风和曲洋死在了左冷禅的追兵手下。福威镖局总镖头林震南死前将失传已久的辟邪剑谱的下落告知令狐冲，使得令狐冲在江湖中处于四面楚歌的不利地位。之后，令狐冲意外习得神功，却因此遭到了师傅岳

明朝年间，禁宫秘籍“葵花宝典”神秘失窃，锦衣卫大太监怀疑是古建林震南所为，为免失宝消息外传，收买武林人士左冷禅暗中查实，遂派锦衣卫古金福率众出京直捣林府。与此同时，各路英雄为追寻藏书之地，互相残杀；生性率直的华山派大弟子令狐冲与师妹岳灵珊受命救援都督林震南。令狐冲初入江湖时，武功平平，后得剑宗高人风清扬授以独孤九剑，结识了魔教长老曲洋与衡山派刘正风，二人在临终之时授予令狐冲笑傲江湖之曲，令狐冲在逃避追杀时无意中与日月神教教主之独生女任盈盈相交...